机器人共同19测试实验室
随着全国各地的医生争先恐后地诊断Covid-19的病例,加利福尼亚大学的科学家,伯克利大学的创新基因组学研究所(IGI)正在从Scratch创建一个诊断实验室,每天可以处理超过1,000名患者样本。
这个弹出窗口实验室,一个独特的学术和企业合作伙伴团队的努力,将为拥有的人提供迫切需要的测试能力新冠肺炎症状,还可以帮助公共卫生官员评估流行病的普遍性。詹妮弗说:“加州大学伯克利分校团队正在通过建立一个测试实验室来解决这种关键的公共卫生状况,该实验室将立即在我们的社区中产生影响,同时还产生了有助于了解SARS-COV-2病毒传播的数据。”Doudna,分子和细胞生物学教授,化学和IGI执行董事。SARS-COV-2是导致COVID-19的冠状病毒。
Thanks to the emergency modification of state and federal regulations and California’s declared state of emergency, the IGI was able to partner with clinicians at University Health Services, UC Berkeley’s student health center, and both local and national companies to bring in the robotic and analytical equipment needed, establish a safe and robust pipeline for clinical sample intake and processing, obtain the required regulatory approvals and train a crew of highly skilled scientists accustomed to conducting fundamental research to analyze patient swabs with a quick-turnaround goal of less than 24 hours.
科学家 - 来自加州大学伯克利分校,加州大学旧金山分校和当地数据管理公司的50多名志愿者计划在本周初测试其第一个实际病毒样品,并旨在下周根据临床实验室改进修订(CLIA)计划进行认证。
虽然测试实验室最初将重点放在加州大学伯克利分校社区的学生和其他成员的样本上,但该团队已经与东湾周围的医疗中心进行协调,最终提供了快速的周转,以满足他们的诊断需求。“我们动员了一支有才华的学术科学家团队,与公司的专家合作,并在几天之内团结起来,像生物技术公司一样运作。这确实是一个了不起的故事。
该实验室将根据食品药品监督管理局批准的过程进行测试,但吞吐量要比许多商业实验室更高,其中一些实验室必须一次手动运行样品。高通量机器是从校园研究实验室采购的,可以一次测试300多个样品,并在收到患者拭子后不到四个小时的时间内提供诊断结果。使用机器人技术和简化的过程,IGI弹出窗口实验室将很快每天进行1,000次测试,如有必要,每天可以进行高达3,000次测试。“我们正在以一种利用方式实施现有测试机器人技术迅速的周转时间,以便我们可以迅速将结果交付给东湾周围的医疗中心,并在这段需要时为我们的社区提供关键服务。”杜德纳说。
加州大学伯克利分校的大学卫生服务助理副校长盖伊·尼科莱特(Guy Nicolette)说:“这只是一个了不起的机会。”“我惊讶于伯克利能够动员起来的速度和利用新规则,以便更快地进行创新。实验室的一面是如此依赖人的手动工作,以至于这在很多方面都会改变游戏规则。”
考虑到加利福尼亚可用的测试套件数量的限制,以及应对谁进行测试的准则,UHS Tang Center的医务人员必须从学生那里寄出几十只拭子,以通过当地商业实验室进行测试。对导致COVID-19的SARS-COV-2病毒呈阳性。但是根据尼科莱特(Nicolette)的说法,湾区的周转量变化很大,可能超过一周,使有症状的患者和临床医生不确定其状态,常常会引起焦虑。
他对校园内诊断实验室将允许大量更广泛的测试对病毒的流行程度更好,因为许多人遭受轻度或没有症状,但可以具有传染性,因此可以更好地了解该病毒的流行程度。他说,大规模测试一直是其他国家通过识别受感染者控制疾病传播的能力的关键。他说:“更广泛的测试还有其他方面的临床功能。”“我们可以根据我们发现的发现,可以更好地决定健康,工作,可能需要在社交上继续距离的时间。”
IGI技术与翻译科学总监Fyodor Urnov在3月13日在研究所内举行了59人会议之后,在动员资源(设备,人员和金钱)中发挥了重要作用。在大多数大学的数十个实验室中,常规的基本技术(从样品中分离RNA并扩增了RNA)是大多数大学的数十个实验室中的常规技术。乌尔诺夫(Urnov)说,钥匙是要迅速弄清楚如何扩展和自动化临床使用过程。
拥有高通量PCR机器的加州大学伯克利分校的实验室将其设备捐赠给了原因,而IGI建立了机器人样品处理以及安全的数据管理。“我们将研发(研发)思维方式投入到了解如何扩展和加速的方式,因为我们了解了医学界的这种基本需求,”分子和细胞生物学教授Urnov说,他花了15年到加州大学伯克利分校之前,生物技术行业。“我们作为科学家的人真正与未满足的需求联系在一起。”
对患者样品的临床测试受到了高度调节,不仅需要实验室科学家的CLIA认证,而且需要实际的实验室空间,设备和质量控制程序的认证。虽然Tang Center有两个经过CLIA认证的实验室科学家,但该中心没有测试SARS-COV-2等病毒所需的生物安全2级(BSL2)实验室。
Thanks to the new regulations, however, the Tang Center’s certification is being extended to the BSL2 lab in the IGI, and the scientists who volunteered to do the testing are now taking an accelerated training program to be able to operate the equipment 24/7, if necessary.
乌尔诺夫说,除了快速周转外,主要重点是准确性,这使疾病控制和预防中心的原始测试套件和在美国流行病开始时的关键月份的广泛测试延迟了。他说:“我们拥有控制控制权。”“当我们告诉临床医生他们的患者是正还是阴性时,许多工作已经确保我们是准确的。”
随着URNOV和他的团队加强诊断技术,加州大学伯克利分校的其他研究人员已经分成了大约十几个“快速研究响应团队”,以专注于其他与COVID相关的研究项目,包括可能改进的诊断药物,新药物来治疗感染和方法向患者输送药物。杜德纳说:“我们谈论的是一群积极参与研究项目的人,包括来自UCSF,Stanford和Gladstone Institutes的人。”“这些长期项目满足了了解这种病毒家族并为将来的爆发做准备的持续需求。”
资源:加州大学伯克利分校