在早期阶段冠状病毒在大流行期间,检测需求的迅速增加导致需求高峰期间出现瓶颈,因此需要采用新的方法来提高检测能力。研究人员能够重新利用现有的高通量机器人平台,以帮助NHS的诊断实验室避免这些瓶颈——减少对其他需求旺盛的试剂的依赖测试平台在全国范围内,它们的供应非常有限。
该团队现在已经在期刊上的一篇论文中公布了他们工作的全部细节自然通讯这样这项技术就可以更广泛地用于测试目的。
根据该团队的说法,这项研究首次展示了在合成生物学研究中使用机器人平台的biofounddries可以帮助世界各地的医疗服务机构快速应对新出现的情况传染性疾病在未来的威胁。除了帮助新型冠状病毒肺炎他们希望这将有助于开发低成本的传染病检测平台,如HIV,肝炎和流感.
提高能力
这些平台通常位于帝国理工学院白城校区的伦敦生物铸造厂(London bioffoundry),通常用于一系列前沿研究项目,包括研究易受感染人群(如痴呆症患者)的感染原因。
每台机器可在12小时内加工1000个样品。但在英国痴呆症研究所的初始资金支持下,保罗·弗里蒙特教授领导的一个团队能够对该平台进行调整,以帮助检测导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的活动性感染病例。这项技术现在已经在NHS中使用病理在那里,该系统帮助诊断团队在当地COVID-19暴发后的短短5天内检测了5000个样本。
弗里蒙特教授说:“我们当时在争分夺秒地工作,被迫以一种全新的方式来思考我们的技术。我们很早就意识到,我们需要与NHS的同事们并肩工作,以确保我们能给他们提供在实验室里可行的东西。我们需要能够快速部署它,并将其扩大以满足需求。这是一个巨大的挑战,但我们都完全致力于让它发挥作用,即使这意味着在这一过程中坚持通过无数的障碍和挑战。”
适应现有的平台
为了重新利用机器人平台,帝国理工团队必须创建新的软件和硬件,并开发新的测试标准,以确保高重现性的结果。在现有的临床抗原检测平台的基础上,他们应用了两种新的检测方法;基于基因编辑蛋白CRISPR以及一种名为LAMP的强有力的变色试验。
他们与帝国理工学院NHS医疗信托基金的临床同事合作,然后能够在患者样本上验证他们的平台,以显示该平台的对比情况。据该团队表示,他们的平台将有助于克服瓶颈,因为它可以重新校准,以使用来自许多制造商的试剂,从而克服与供应链相关的问题。
传染病部的迈克尔·克龙博士说:“值得注意的是,与其他工作流程相比,该机构需要的训练有素的工作人员更少。因此,我们与我们的西北伦敦病理学同事一起开发并验证了一个真正强大的、可扩展的、自动化的诊断测试平台。这一工作流程将为其他在英国和其他低收入和中等收入国家实施的工作提供蓝图。”
自动化经理Marko Storch博士补充道:“对我们来说,分享我们的见解和提供我们的工作流程是很重要的,希望这份出版物能够为社区在其他地方实施类似的系统提供一些支持。”
来源:伦敦帝国理工学院