DELFI血液检测使用人工智能检测肺癌
DELFI血液检测使用人工智能来检测癌细胞脱落DNA片段的独特模式,以识别肺癌。
来源:卡洛琳Hruban
25.08.2021•

人工智能血液检测可以检测90%以上的肺癌

由约翰·霍普金斯大学金梅尔癌症中心的研究人员开发的一项新的人工智能血液检测技术发现,在近800名肺癌患者和非癌症患者的样本中,可以检测出超过90%的肺癌。

这种测试方法被称为DELFI (DNA碎片早期截取评估),它在血液循环中癌细胞脱落的DNA碎片中发现了独特的模式。将这项技术应用于丹麦、荷兰和美国796名患者的血液样本,研究人员发现DELFI方法可以准确区分肺癌患者和非肺癌患者。

将该检测与临床危险因素分析、蛋白质生物标记以及随后的计算机断层成像相结合,DELFI帮助检测了94%的分期和亚型癌症患者。这包括91%的早期或侵袭性较低的I/II期癌症患者和96%的晚期III/IV期癌症患者。

肺癌是癌症死亡的最常见原因,每年在全世界夺走近200万人的生命。资深研究作者Victor E. Velculescu医学博士解释说,尽管预测可以避免成千上万的死亡,但只有不到6%的有肺癌风险的美国人接受了推荐的低剂量计算机断层扫描筛查,而在世界范围内接受筛查的人甚至更少。肿瘤学教授,约翰霍普金斯大学金梅尔癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)癌症遗传学和表观遗传学项目主任。这是由于各种原因,包括对假阳性成像结果调查的潜在危害的担忧,辐射暴露或对侵入性手术并发症的担忧。“很明显,临床迫切需要开发替代药物,但尚未得到满足,非侵入性该研究的主要作者、约翰霍普金斯大学基梅尔癌症中心的博士后迪米特里奥斯·马蒂奥斯说:“这是一种提高对高危人群以及最终对普通人群癌症筛查的方法。”“我们认为,针对肺癌的血液检测或‘液体活检’可能是一种加强筛查工作的好方法,因为它容易操作、广泛获取且具有成本效益。”

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DELFI技术使用血液测试来间接测量DNA通过研究来自基因组不同区域的循环中的细胞游离DNA的大小和数量,将其封装在细胞核中。健康细胞把DNA打包成一个井然有序的手提箱,基因组的不同区域被小心地放在不同的隔间里。相比之下,癌细胞的细胞核就像杂乱无章的手提箱,来自基因组的各种物质杂乱无章地扔在里面。当癌细胞死亡时,它们以混乱的方式将DNA释放到血液中。DELFI帮助识别存在的癌症使用机器学习这是一种人工智能,用于检测数百万细胞游离DNA片段的异常模式,包括不同基因组区域DNA的大小和数量。这种方法提供了被称为“碎片组”的细胞游离DNA的观点。研究人员说,DELFI方法只需要低覆盖率的基因组测序,这使得该技术在筛查环境中具有成本效益。

在这项研究中,约翰霍普金斯大学的研究人员与丹麦和荷兰的研究人员合作,首先对365名参与丹麦卢卡斯研究的人的血液样本进行了细胞游离DNA的基因组测序。大多数参与者患肺癌的风险较高,并且有与吸烟有关的症状,如咳嗽或呼吸困难。DELFI方法发现,后来被确定患有癌症的患者在他们的碎片组谱中有广泛的变异,而被发现没有患癌症的患者的碎片组谱是一致的。随后,研究人员使用385名非癌症患者和46名癌症患者验证了DELFI技术。总的来说,该方法检测出超过90%的肺癌患者,包括早期和晚期以及不同亚型的肺癌患者。“DNA碎片模式为癌症的早期检测提供了一个显著的指纹,我们相信这可能是广泛应用于肺癌患者的液体活检检测的基础,”作者Rob Scharpf博士说,他是约翰霍普金斯大学基梅尔癌症中心的肿瘤学副教授。

由约翰霍普金斯大学附属机构Delfi Diagnostics赞助的首个名为Delfi - l101的国家临床试验正在评估一项基于Delfi技术的测试,该测试在美国1700名参与者中进行,其中包括健康参与者、肺癌患者和其他癌症患者。该小组希望进一步研究DELFI在其他类型癌症中的作用。

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