布伦丹加拉格尔是Carnegie Mellon的生物科学研究生......
布伦丹·加拉格尔是卡耐基梅隆大学的一名生物科学研究生,他利用虚拟现实技术来检查用扩展显微镜收集的3D生物数据。
资料来源:卡内基梅隆大学

显微镜和VR照亮治疗疾病的新方法

这些技术的开发分为两个阶段,由比尔和梅林达·盖茨基金会发起的“大挑战”项目提供20万美元资金,将加快研究人员对传染性和自身免疫性疾病的理解,并增强他们开发疾病诊断和预防和治疗方法的能力。

Carnegie Mellon Mellon科学梅隆科学学院的生物科学助理教授Zhao一直在开发膨胀显微镜技术,以物理放大活检,允许研究人员使用标准显微镜在生物样品中看到精细细节。

Zhao使活组织检查样品通过将它们化学转化成水溶性水凝胶来生长大小。然后,他采用一种松散组织的治疗,并允许它们在体积上扩大超过100倍。然后可以将样品中的组织和分子标记,成像和编译成复杂的数据集,以用于研究细胞及其结构之间的相互作用。

然而,该技术的限制是它提取两到三个大小的数量级比当前技术能够解释。为了帮助解决这个问题,盖茨基金会授予对扩展显微镜,并在弗吉尼亚梅森(BRI)的贝纳罗摩研究所开发的虚拟现实技术。

通过专门为此目的开发的VR技术,研究人员将能够在3D中看到和操作最初的2D扩展显微镜图像,给他们提供组织和蛋白质组织和相互作用的360度视图。“在BRI,我们将准备活的传染病和自身免疫性疾病样本,”高级博士后研究员卡罗琳·史蒂芬尼(Caroline Stefani)说。“我们将把这些样本送到卡内基梅隆大学,在那里,他们将放大样本,并把图像发送回BRI,在虚拟现实中观看。”

“这是未来科学家处理复杂数据的方式,”赵说。“这是一种身临其境的体验,就像你坐在数据中一样。你可以自由地从每个角度、每个地点探索你的数据。”

这种虚拟现实技术是由Tom Skillman开发的,他是BRI的前研究技术总监,后来创立了一家虚拟现实公司,沉浸式科学。Skillman说:“我在这项资助中的角色是开发一个软件工具,让科学家通过一种称为‘沉浸式科学’的计算技术来研究疾病,从而理解大量数据。”“将所有数据引入虚拟现实不仅允许科学家看到他们2 d显微镜图像完整的3 d,但与数据交互,选择渠道,调整视图、颜色和对比,抓住和旋转图像的图像快速识别关键方面,耦合回疾病研究。”

最终目标是对于VR工具,称为EXMICROVR™,与其他研究人员一起共享,以及扩展显微镜,以便他们也可以查看疾病过程的新细节,并理解更大,更复杂的数据集。

将扩展显微镜数据转换为VR 3D图像的系统将是价格实惠的,并且可以在发展中国家的研究人员和医生方便地获得。它还将允许最多六人协作和查看同一样本。

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