赵和他的同事使用单分子荧光技术显微镜直接观察这两种基因组编辑工具如何在活的哺乳动物细胞中执行。荧光标签使研究人员能够测量CRISPR和TALEN沿DNA移动以及检测和切割目标位点需要多长时间。
“我们发现,CRISPR在基因组伤口不那么紧密的区域工作得更好,但TALEN可以比CRISPR更好地访问那些异染色质区域的基因,”赵说。“我们也看到TALEN可以比CRISPR有更高的编辑效率。它可以切断DNA,然后比CRISPR更有效地做出改变。”
在多次实验中,TALEN的效率是CRISPR的5倍。赵说,这些发现将有助于改进针对基因组不同部分的方法。“要么我们可以将TALEN用于特定的应用,要么我们可以尝试让CRISPR在异染色质中更好地工作,”他说。
研究人员在杂志上报告了他们的发现自然通讯.
来源:伊利诺伊大学香槟分校