基因组编辑工具TALEN在紧密封装的DNA中表现优于CRISPR-Cas9。
基因组编辑工具TALEN在紧密封装的DNA中表现优于CRISPR-Cas9。
来源:伤风/ Solcan设计

基因编辑工具TALEN优于CRISPR-Cas9

伊利诺伊大学香槟分校(University of Illinois at Urbana-Champaign)的研究人员使用单分子成像技术比较了基因组编辑工具CRISPR-Cas9和TALEN。他们的实验显示,TALEN在基因组中高密度排列的异染色质部分的效率是CRISPR-Cas9的5倍。脆性X染色体综合征、镰状细胞贫血、地中海贫血和其他疾病都是异染色质遗传缺陷的结果。

这项研究进一步证明,更广泛的选择基因编辑伊利诺伊大学香槟分校(University of Illinois Urbana-Champaign)化学和生物分子工程教授赵惠民(音译)领导了这项新研究,他说,需要使用工具来针对基因组的所有部分。”CRISPR是一个非常强大的工具,导致了一场革命基因工程,”赵说。“但它仍有一些局限性。”

CRISPR是一种检测入侵病毒的细菌分子。它可以携带多种酶中的一种,如Cas-9,这些酶允许它在特定的位点切割病毒基因组。TALEN还扫描DNA,以找到并瞄准特定的基因。CRISPR和TALEN都可以针对特定的基因进行改造,以对抗疾病,改善作物的特性或用于其他应用。

赵和他的同事使用单分子荧光技术显微镜直接观察这两种基因组编辑工具如何在活的哺乳动物细胞中执行。荧光标签使研究人员能够测量CRISPR和TALEN沿DNA移动以及检测和切割目标位点需要多长时间。

“我们发现,CRISPR在基因组伤口不那么紧密的区域工作得更好,但TALEN可以比CRISPR更好地访问那些异染色质区域的基因,”赵说。“我们也看到TALEN可以比CRISPR有更高的编辑效率。它可以切断DNA,然后比CRISPR更有效地做出改变。”

在多次实验中,TALEN的效率是CRISPR的5倍。赵说,这些发现将有助于改进针对基因组不同部分的方法。“要么我们可以将TALEN用于特定的应用,要么我们可以尝试让CRISPR在异染色质中更好地工作,”他说。

研究人员在杂志上报告了他们的发现自然通讯

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